Директор: И.И. Садиков
Заместитель директора по научной работе: М.Ю. Ташметов
Ученый секретарь: А.П. Мухтаров
Ученый совет
Заместитель директора по научной работе (курирует направление «Ядерная физики и активационного анализа»)
- Лаборатория «Теоретической ядерной физики»
- Лаборатория «Физики многочастичных систем»
- Лаборатория «Ядерной астрофизики»
- Лаборатория «Ядерных технологий и физики ядерных реакторов»
- Лаборатория «Ядерной медицины»
- Лаборатория «Ядерной аналитики»
- Лаборатория «Радиохимии»
Заместитель директора по инновации, внедрениям и международным связям (курирует направление «Радиационная физика твердого тела»)
- Лаборатория «Радиационной физики оптических явлений»
- Лаборатория «Радиационной физики и техники твердотельной электроники»
- Лаборатория «Структурные превращения в твердых телах»
- Лаборатория «Физики наноструктурных и сверхпроводящих материалов»
- Лаборатория «Физики и технологии циклотронных радиоизотопов»
- Лаборатория «Междисциплинарных технологий»
- Лаборатория «Экологии и биотехнологии»
- Служба эксплуатации ядерного реактора
- Служба эксплуатации нейтронного генератора
- Служба эксплуатации циклотрона У-150
- Республиканская центральная изотопная лаборатория
- Служба эксплуатации гамма установки
- Служба очистки радиоактивных отходов
- Служба эксплуатаци иускорителя электронов “Электроника У-003”
Заместитель директора по общим вопросом: О.С. Лутфуллаев
- Главный инженер
- Служба ядерной и радиационной безопасности
- Служба пожарной безопасности
- Служба благоустройства санитарно-защитной зоны
- Административно-хозяйственная и инженерно-техническая служба
- Отдел информационно-коммуникационной службы
- Информационно-аналитическая служба
- Республиканский пункт захоронения радиоактивных отходов
- ГП «Радиопрепарат»
- ГП «Конструкторское бюро с опытным заводом»
- Главный юристконсульт
- Отдел кадров
- Канцелярия
- Спецчасть
- Бухгалтерия