В институте ядерной физики деятельность по подготовке кадров проводится по различным направлениям.
Готовятся кадры высокой квалификации через институт старших научных сотрудников-соискателей (докторантуру). В настоящий момент в нем обучаются 7 человек.
До упразднения аспирантуры (январь 2013 г.) в ней обучалось ежегодно 10-12 человек.
Институт в 2009-2013 гг. заключил договора о творческом содружестве с 9 ВУЗами Республики. В соответствии с этими договорами институт обязуется обучать присылаемых магистрантов, принимать на стажировку молодых специалистов из ВУЗов, открывать совместно с ВУЗами филиалы кафедр и т.д.
На протяжении многих лет институт по вопросу подготовки кадров тесно взаимодействует с Национальным Университетом Узбекистана и его физическим факультетом, являющимся основным поставщиком молодых кадров в институт. В целях углубления и расширения этого взаимодействия в 2007 г. на основе двухстороннего приказа создан и функционирует Учебно-научный центр ядерной и теоретической физики. В 2012 г. на базе этого центра создан Учебно-научный комплекс «Ядерная и теоретическая физика», осуществляющий координацию работ по подготовке кадров.
В целях выполнения Национальной программы подготовки кадров и привлечения в институт молодых специалистов ряд ученых института преподает в ВУЗах (главным образом на физфаке НУУ), лицеях, колледжах и школах. В настоящее время к преподавательской деятельности в учебных заведениях привлечено 28 ученых института.
Налажено обучение магистрантов также непосредственно в институте. Теоретические и практические занятия проводятся в специально оборудованных аудиториях по согласованным программам. Магистранты с первого курса прикрепляются к конкретным лабораториям и научным руководителям и знакомятся с проводимыми в лаборатории работами. Начиная со второго курса, они активно включаются в выполнение магистерских диссертационных работ, которые, как правило, находятся в соответствии с тематикой лаборатории.
Между институтом и физическим факультетом НУУ в 2002 году заключен специальный договор, по которому институт оплачивает учебу части магистрантов-контрактников с условием их отработки в институте не менее 4 лет после окончания учебы. Такая политика помогает закреплению большей части выпускников в институте, способствуя омоложению кадров.
В институте более 20 лет функционирует Малый Университет, призванный координировать взаимодействие с учебными заведениями, привлекать сотрудников к преподавательской деятельности и проводить работу по повышению квалификации молодых ученых института. Силами Малого Университета проводятся также ежегодные физико-математические Олимпиады «Навруз» среди школьников Мирзо-Улугбекского и Кибрайского районов с вручением победителям Олимпиад дипломов и денежных премий на заседании Ученого Совета института.
Институт активно направляет своих докторантов и молодых ученых в зарубежные командировки. Так в 2013 г. 13 человек выезжали для участия в работе международных конференций и семинаров, 7 человек направлялись на научные стажировки, школы и тренинг-курсы, 6 человек находились в длительных командировках, выполняя совместные научные исследования.
Таким образом, тесное взаимодействие института с Национальным Университетом Узбекистана и другими ВУЗами и учебными заведениями Республики, проводимая политика всесторонней поддержки молодых ученых, помогают институту эффективно решать кадровую проблему и способствуют претворению в жизнь Национальной программы подготовки кадров.